Plan docente de la asignatura

 

 

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Datos generales

 

Nombre de la asignatura: Microbiología Ambiental

Código de la asignatura: 361527

Curso académico: 2021-2022

Coordinación: Maria Teresa Muniesa Perez

Departamento: Departamento de Genética, Microbiología y Estadística

créditos: 6

Programa único: S

 

 

Horas estimadas de dedicación

Horas totales 150

 

Actividades presenciales y/o no presenciales

50

 

-  Teoría

Presencial

 

30

 

-  Prácticas de laboratorio

Presencial

 

15

 

-  Seminario

Presencial

 

5

Trabajo tutelado/dirigido

50

Aprendizaje autónomo

50

 

 

Competencias que se desarrollan

 

   -

Capacidad de aprendizaje y responsabilidad (capacidad de análisis, de síntesis, de visiones globales y de aplicación de los conocimientos a la práctica/capacidad de tomar decisiones y adaptación a nuevas situaciones)

   -

Capacidad comunicativa (capacidad de comprender y de expresarse oralmente y por escrito en catalán,castellano y en una tercera lengua, dominando el lenguaje especializado/capacidad de buscar, usar y integrar la información)

   -

Capacidad de consideración multidisciplinar de un problema ambiental

(Capacidad de consideración multidisciplinar de un problema ambiental.)

   -

Conocer la funcionalidad, diversidad y distribución de los seres vivos.

(Conocer la funcionalidad, la diversidad y la distribución de los seres vivos.)

   -

En la mesura del que sigui possible, s¿incorporarà la perspectiva de gènere en el desenvolupament i activitats de l¿assignatura.

 

 

Objetivos de aprendizaje

 

Referidos a conocimientos

El objetivo general de la asignatura es adquirir una visión general y sólida de los microorganismos como seres vivos y de su relación con el entorno y la actividad humana.

Los objetivos específicos son:

— Conocer los microorganismos y los virus como seres vivos, con el énfasis puesto en sus características diferenciales, tanto a escala estructural como funcional.

— Entender las relaciones de los microorganismos con el medio natural, con el hombre y con otros organismos, así como su incidencia en los procesos naturales.

— Adquirir una visión general de los microorganismos y de sus aplicaciones en el medioambiente.

Teniendo en cuenta que adicionalmente se imparten asignaturas sobre fundamentos de biología vegetal y animal, el programa se centrará sobre todo en el estudio de bacterias y virus, aunque incluirá un tema general sobre los microorganismos eucariotas.

 

 

Bloques temáticos

 

Programa

1. El mundo microbiano. Concepto de microorganismo. Tipos de microorganismos. Tamaño y forma de los procariotas y los virus. Técnicas microscópicas. Ámbitos de la microbiología

2. Envoltorios bacterianos. La membrana plasmática. Estructura y composición química. Funciones de la membrana. La pared celular en grampositivos y gramnegativos. Funciones de la pared celular

3. Citoplasma y nucleoide. Citoplasma. Inclusiones citoplasmáticas. Ribosomas procariotas. Nucleoide

4. Componentes externos a la pared celular y movimiento. Cápsulas y limos. Funciones biológicas. Fimbrias y pili. El flagelo procariota. Mecanismo del movimiento flagelar. Tactismos

5. Catabolismo: obtención y conservación de la energía. Fuentes de carbono y energía de los microorganismos. Clasificación nutricional. Quimioorganotrofos. Metabolismo respiratorio. Respiración anaerobia. Fermentación. Quimiolitotrofía. Fototrofía

6. anabolismo: utilización de la energía en biosíntesis. Metabolitos precursores. Fijación de CO2. Incorporación de las fuentes de azufre y de nitrógeno. Fijación de nitrógeno. Reacciones de polimerización

7. Crecimiento microbiano. Ciclo celular bacteriano. Cultivo de microorganismos. Curva de crecimiento. Metabolismo secundario. Cultivo continuo. Influencia de los factores ambientales en el crecimiento. Control del crecimiento

8. Características de la genética de los procariotas. Organización del material genético. Cromosoma y plásmidos

9. Variabilidad genética y aplicaciones de la genética de los procariotas. Mecanismos de variabilidad genética. Microorganismos: herramientas para la biotecnología y la investigación

10. Diversidad microbiana. Nomenclatura e identificación. Caracterización de las especies bacterianas. Bacteria y Archaea, grupos con mayor significación medioambiental. Diversidad de los microorganismos eucariotas

11. La naturaleza de los virus. Diversidad de los virus. Clasificación y taxonomía de los virus. Principales grupos de virus de interés en microbiología ambiental. Tipos de infecciones víricas

12. Laboratorios de microbiología ambiental. Aseguramiento de la calidad. Laboratorios acreditados. Recolección y procesamiento de muestras ambientales. Métodos en microbiología ambiental

13. Transporte de microorganismos en el medioambiente. Factores intrínsecos de los microorganismos que afectan al transporte. Factores hidrogeológicos. Persistencia y actividad de los microorganismos introducidos. Metodologías para estudiar el transporte

14. Residencias microbianas. Ambientes terrestres. Actividades microbianas en los medios porosos. Microorganismos en suelos a diferentes profundidades. Interfaz agua-aire. Medio acuático. Plancton, bentos, mantos microbianos y biofilms. Ambientes extremos. Aeromicrobiología. Bioaerosoles

15. Interacciones microbianas. Mutualismo. Comensalismo. Parasitismo. Simbiosis entre bacterias. Microbiota autóctona del cuerpo humano

16. Ciclos biogeoquímicos. La hipótesis GAIA. El ciclo del carbono. El ciclo del nitrógeno. El ciclo del azufre. Corrosión. Óxido nitroso en la atmósfera. Nitratos en aguas subterráneas. Biogénesis de halometanos y organoclorados. Papel de los microorganismos en la eliminación de contaminantes

17. Consecuencias de la supervivencia y transporte de microorganismos. Microorganismos patógenos en la agricultura y la ganadería. Microorganismos patógenos para el hombre. Ingeniería sanitaria. Biotecnología ambiental

Prácticas

Identificación de microorganismos:

— Observación microscópica de bacterias. Tinciones de Gram, de esporas y de cápsulas

— Aislamiento de bacterias a partir de una población mixta

— Obtención de cultivos puros

— Inóculo y lectura de diferentes pruebas bioquímicas

— Detección de la motilidad bacteriana

— Identificación de microorganismos aislados

Curva de crecimiento de una población bacteriana

Detección de bacteriófagos

 

 

Metodología y actividades formativas

 

Actividades presenciales

Se llevarán a cabo dos sesiones semanales de una hora de clases magistrales durante un periodo de quince semanas. De estas, dos se harán en formato virtual y una presencial. Como apoyo de las clases magistrales, se utilizará, además de la pizarra, material audiovisual en formato electrónico (presentaciones en PowerPoint, vídeos, acceso directo a URL, etc.) para facilitar el seguimiento de los contenidos explicados. El material en formato electrónico está disponible en la plataforma del Campus Virtual. Las lecciones virtuales se realizarán mediante la herramienta BB Collaborate disponible en el Campus Virtual.

Las prácticas de laboratorio se impartirán en grupos reducidos y durante una semana intensiva en sesiones diarias de 3 horas seguidas. Como parte de los seminarios, hay cuatro sesiones de 1 hora en las que se trabajarán presencialmente estas actividades. La presencialidad podrá incluir grupos de discusión, debates, exposición de artículos y pruebas de evaluación de la actividad.

La prueba de síntesis se hará a la vez para todo el alumnado en una sesión de dos horas.

 

Actividades no presenciales

Los seminarios los tutorizará el profesorado y se podrán hacer en grupos. Las actividades dirigidas propuestas en los seminarios incluirán proyectos centrados en aspectos transversales de la asignatura propuestos por el profesorado que se trabajarán mediante lecturas, revisiones bibliográficas, grupos de discusión y puestas en común en sesiones presenciales.

Como parte del aprendizaje autónomo, antes de las clases presenciales de teoría, el alumnado deberá revisar el material docente que haya indicado el profesor. Después de las clases teóricas, deberá estudiar los contenidos impartidos, utilizando no solo las notas de las clases, sino también el material docente complementario sugerido por el profesorado, incluyendo los libros y artículos recomendados. Es necesario que el alumno se organice para las tareas requeridas teniendo en cuenta los plazos y el calendario establecidos para desarrollarlas y presentarlas.

Los contenidos, actividades y metodologías propuestas podrán modificarse en función de las indicaciones de las autoridades sanitarias.

 

En la medida de lo posible se incorporará la perspectiva de género en el desarrollo y actividades de la asignatura.

 

 

Evaluación acreditativa de los aprendizajes

 

Se hará una evaluación continua de los aprendizajes, conocimientos, habilidades y actitudes previstos en los objetivos y en los contenidos de la materia.

Para aprobar la asignatura se deberá haber aprobado la teoría y las prácticas, por separado. Para evaluar la parte de teoría se tendrán en cuenta las calificaciones ponderadas de las pruebas de síntesis (75 %) e integrativa (25 %). Si se ha aprobado la teoría y las prácticas, para obtener la calificación final de la asignatura se tendrá en cuenta la nota de las prácticas de laboratorio (20 % de la nota final), la de los seminarios (15 % de la nota final ), la de la prueba de síntesis + la de la prueba integrativa (65 % de la nota final).

La asistencia a los seminarios y a las prácticas es obligatoria. En caso de que la ponderación de las notas de la prueba de síntesis y la prueba integrativa no llegue al aprobado, estas notas no se combinarán con las notas de prácticas ni de los seminarios para calcular la calificación final, y la nota que constará en el acta será la nota ponderada de estas dos últimas pruebas. Si el estudiante no se presenta a la prueba de síntesis o a la prueba integrativa, la calificación será de no presentado.

Para aprobar las prácticas se requiere la asistencia continuada obligatoria durante los días que se llevan a cabo y la evaluación se basa en las habilidades adquiridas durante el trabajo desarrollado en el laboratorio y un cuestionario al finalizar cada semana de prácticas. Si un alumno suspende las prácticas, podrá optar por hacer un examen global de prácticas al final del curso. La nota de prácticas se guardará, como máximo, dos cursos académicos posteriores a haberlas hecho.

Los seminarios se evaluarán durante las sesiones presenciales correspondientes y mediante pruebas escritas individuales o en grupo. La nota de los seminarios se calculará haciendo la media de las puntuaciones obtenidas en cada actividad. Esta nota se guardará para posteriores convocatorias.

La prueba de síntesis sirve para valorar la adquisición de los conocimientos generales de la materia impartida y constará de preguntas de tipo test. Esta nota no se guardará para posteriores convocatorias.

La prueba integrativa sirve para valorar la integración de los conocimientos adquiridos y la capacidad de relacionarlos. Consta de una o dos preguntas tema para desarrollar. Esta nota no se guarda para convocatorias posteriores.

La evaluación propuesta podrá verse modificada en función de las indicaciones de las autoridades sanitarias.

 

Evaluación única

En caso de que el alumno solicite una evaluación única en sustitución de la evaluación continua, lo hará mediante un documento único, firmado por él y por el profesor. Esta solicitud se presentará durante el periodo fijado por la Facultad y será definitiva e irreversible. Aunque el alumno se acoja a la evaluación única, tendrá que hacer las prácticas en sesiones presenciales. La evaluación única se hace el mismo día que la prueba de síntesis e incluye la evaluación de los conocimientos correspondientes a los seminarios.

 

Reevaluación

Para hacer la reevaluación se seguirán las normas establecidas por la Comisión Académica de la Facultad de Biología. Para optar a ella, será un requisito indispensable haber hecho los seminarios y tener aprobadas las prácticas.

Tanto la evaluación única como la continua, y la reevaluación, se llevarán a cabo atendiendo a las convocatorias oficiales de la Facultad de Biología.

La evaluación propuesta podrá verse modificada en función de las indicaciones de las autoridades sanitarias.