Plan docente de la asignatura

 

 

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Datos generales

 

Nombre de la asignatura: Ecología Microbiana

Código de la asignatura: 361687

Curso académico: 2021-2022

Coordinación: Jordi Urmeneta Maso

Departamento: Departamento de Genética, Microbiología y Estadística

créditos: 6

Programa único: S

 

 

Horas estimadas de dedicación

Horas totales 150

 

Actividades presenciales y/o no presenciales

56

 

-  Teoría

Presencial y no presencial

 

28

 

-  Prácticas de laboratorio

Presencial

 

15

 

-  Salida cultural

Presencial

 

13

Trabajo tutelado/dirigido

44

Aprendizaje autónomo

50

 

 

Objetivos de aprendizaje

 

Referidos a conocimientos

El objetivo principal de la asignatura es introducir al alumnado en el conocimiento actual de la ecología microbiana y en la metodología utilizada para obtener este conocimiento. Se analiza cómo los microorganismos fueron clave en la evolución de la vida en nuestro planeta. Además, se estudia la presencia en la actualidad de microorganismos en distintos ambientes y su elevada diversidad. Se incide también en el hecho de que los microorganismos no pueden considerarse como organismos aislados, sino que interaccionan entre ellos y con el medioambiente. El microbioma, por tanto, es imprescindible para el funcionamiento de los ecosistemas y para el desarrollo de los ciclos biogeoquímicos en la Tierra. Asimismo, se incide en el análisis y comprensión de artículos científicos de investigación primaria y en la capacidad para buscar información y comunicar a través de internet.

 

 

Bloques temáticos

 

1. Contenidos

1.1. Historia y desarrollo de la ecología microbiana. Primeros estudios. Cultivos axénicos y cultivos mixtos. La Escuela de Delft

1.2. Métodos de datación. Fraccionamiento isotópico. Estromatolitos. Cambio de gases. Evolución del potencial redox. Eones arqueano, proterozoico y fanerozoico

1.3. Ecología microbiana cuantitativa. Muestreo. Biomasa y actividad. Medida del crecimiento individual y poblacional. Detección y cuantificación molecular de microorganismos del ambiente

1.4. Clasificación y taxonomía microbianas. Taxonomía molecular. Genómica y proteómica. Cinco reinos o tres dominios. Concepto de especie bacteriana. Evolución microbiana

1.5. El dominio Arquea: Euryarchaeota. Crenarchaeota. Ambientes extremos. Generalidades sobre el dominio Bacteria. Proteobacterias

1.6. El ambiente acuático. Ambientes continentales y marinos. Microbiota del agua. Vida planctónica y número de Reynolds. Vida bentónica: adhesión a superficies. Biopelículas. Surgencias termales submarinas. Quimiotaxi. Bacterias magnetotácticas

1.7. Fotosíntesis anaeróbica. Producción e importancia ecológica. Bacterias fototróficas. Comunidades fototróficas anaeróbicas. Lagos kársticos. Tapices microbianos

1.8. El ambiente terrestre. Estructuras de resistencia o anabiosis. Longevidad procariótica. Células diferenciadas y no diferenciadas. Microbiota del suelo. La biosfera subterránea profunda. Metabolismo anammox

1.9. Microbiología del aire. Dispersión y transporte de microorganismos. Microbiología de ambientes cerrados. Esterilización ambiental. Salas blancas y animales gnotobióticos

1.10. Interacción entre microorganismos. Interacción con protistas. Interacción con plantas. Interacción con animales. Bacterias endosimbiontes de insectos. Microbiota humana y patógenos

1.11. Control biológico. Estudio biológico de plagas. Virus, bacterias y hongos como agentes plaguicidas. Fagoterapia. Modificación genética de agentes de control. Antagonismo y antibiosis. Guerra biológica y bioterrorismo

1.12. Biopolímeros microbianos. Polisacáridos, poli-ß-hidroxialcanoato. Proteína unicelular. Polifosfatos. Polisulfuros. Producción y aplicaciones

1.13. Bioacumulación, biodegradación y biorrestauración. Compuestos xenobióticos y recalcitrantes. Utilización de cultivos axénicos y cultivos mixtos. Comunidades microbianas y biodegradación. Plasmidios y vías metabólicas de degradación

1.14. Evaluación de riesgos en la liberación de microorganismos modificados genéticamente. Aplicaciones de la genética molecular en la ecología microbiana. Aspectos legales

1.15. Astrobiología. Posibilidad de vida fuera de la Tierra. Investigaciones en curso

 

 

Metodología y actividades formativas

 

La asignatura consiste en:

  • Actividades presenciales (56 h):
    • Clases magistrales (28 h). Clases teóricas que se hacen en dos sesiones semanales de 1 hora durante 14 semanas. Se utiliza material audiovisual en formato electrónico (presentaciones en PowerPoint, vídeos, etc.) y se fomenta el intercambio de información por medio de la plataforma del Campus Virtual.
    • Prácticas de laboratorio: 15 h totales en una semana intensiva con grupos de 12 alumnos por profesor (o 24 alumnos con dos profesores), con sesiones diarias de 3 h seguidas.
    • Salidas culturales: visita a centros de investigación, asistencia a conferencias y seminarios (13 h).
  • Actividades dirigidas no presenciales (44 h):
    • Comentarios de artículos científicos.
    • Resolución de ejercicios y problemas.


El profesor tutoriza al alumno en las actividades no presenciales dirigidas.
  • Actividades autónomas (50 h):
    • Búsqueda de información
    • Uso de la bibliografía.
    • Estudio.


Los contenidos, actividades y las metodologías propuestos se pueden modificar en función de las indicaciones de las autoridades sanitarias para la COVID-19.

En la medida de lo posible, se incorporará la perspectiva de género en el desarrollo y las actividades de la asignatura.

 

 

Evaluación acreditativa de los aprendizajes

 

Según la normativa de la Universidad de Barcelona (Acuerdo del Consejo de Gobierno de 19 de julio de 2006, capítulo 4, artículos 10-12) la evaluación de la materia es continua de los aprendizajes, conocimientos, habilidades y actitudes incluidos en los objetivos y en los contenidos de la materia. Con vista a la calificación de cada alumno, los profesores de la asignatura tienen en cuenta:

  • Trabajos, comentarios, ejercicios, problemas y discusión de artículos científicos en inglés (20 % de la calificación final).
  • El aprovechamiento de las clases prácticas (20 % de la calificación final).
  • La participación en otras actividades presenciales, como salidas de campo, visitas a centros de investigación y asistencia a conferencias (10 % de la calificación final).
  • El resultado de una prueba de síntesis (50 % de la calificación final).


Para poder aprobar la asignatura se requiere haber hecho las prácticas de laboratorio (obligatorias), haber sacado una nota mínima de 4 en la prueba de síntesis y un mínimo de 5 en la nota final. La prueba de síntesis consiste en una prueba escrita, en la que se da especial importancia al análisis comprensivo y a la discusión de artículos científicos recientes publicados en revistas internacionales.

En caso de haberse presentado a la prueba de síntesis pero no haber alcanzado la calificación de 4, el alumno tiene derecho a una reevaluación. La prueba tiene características similares a las de la prueba de síntesis. Todas las demás actividades del curso no se reevalúan.

La evaluación propuesta podrá verse modificada en función de las indicaciones de las autoridades sanitarias para la COVID-19.

 

Evaluación única

En caso de que el estudiante solicite la evaluación única, deberá hacerlo mediante un documento único, firmado por él y por el profesor. Esta solicitud se hará durante el periodo fijado por la Facultad y será definitiva e irreversible. Aunque el estudiante se acoja a la evaluación única, el profesor puede pedirle que realice actividades presenciales. La evaluación única, que se realiza el mismo día que la prueba de síntesis, se lleva a cabo atendiendo a las convocatorias oficiales de la Facultad de Biología.